甘南州图书馆

同治二年（1863年）陕西回民在白彦虎带领下反清，向甘肃纵深发展。五月，洮州东乡民团与回军在新城东北三角石山头战斗中失利，死亡数百人。六月，洮州南乡新堡民团在马厂沟与回民军战斗亦遭失败，兵备道严长宦等战死。次年八月，洮州反清回民攻下圆城寺（即侯家寺）进而克洮州城（新城）。十二月十二日，巩昌（今陇西）知府赵廷芳，委凉州岔口驿都司张廷秀、忠义营都司王化龙等率兵抵洮，协同卓尼土司杨元办理洮州回案。同治五年（1866年）农历正月二十六日，清政府遣曹光忠督军进剿洮州，洮州起事回民首领马芳等人交械投降，接着攻下了洮州城，回军另一首领丁重选被杀。十月，洮州回民丁永安再次起事，清军副将周潮旺领兵抵洮，回民夜袭清营，喇嘛川回民援军同时进攻，清军腹背受击。十二月初八，洮岷协副将冯光明被杀后，狄道（临洮）回军也进抵洮州，洮州同知熊其光避居卓尼土司衙署。同治六年（1867年），清政府任命左宗棠为陕甘总督办理军务。1868年，左宗棠任陈台为洮州同知，回族首领马芳被杀。