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喀什垦区位于塔克拉玛干大沙漠西缘的喀什地区和克孜勒苏柯尔克孜自治州境内。大多数农牧团场建立在叶尔羌河中下游的冲积平原上。这里也是汉唐屯田地区。唐代的“疏勒七屯”就在这些地方。1965年成立农三师，师部设于喀什市。
  农三师是以原农一师四管处为基础，加上各师抽调的人员，及相继并入的巴楚农场、伽师农场、莎车农场、东风农场，于1965年组建而成。农三师经过20多年的开发建设，到1988年底，有规划土地面积将近692.23万亩，耕地84.9万亩、草原144.26万亩、果树和林地25.28万亩，人口13.6万人，辖农牧团场18个，工交商建企业14个，中、小学校201所。
  该垦区属大陆性气候，海拔1100—1300米，年日照2784小时，有效积温4400—4600℃，光热资源丰富，年平均无霜期220天，降水量61.5毫米，蒸发量2487毫米。垦区内自然资源丰富，有天然胡杨林和红柳等灌木林44.26万亩，甘草13万亩，罗布麻4万亩，可垦荒地200余万亩。土壤为草甸土、盐土、沼土、风沙土4种。
  1988年社会总产值27798万元，工农业总产值20106万元(当年价）。粮食总产40020吨，缴售国家15826吨；棉花总产14795吨，上缴国家13928吨。是兵团的粮棉瓜果基地。现有果园4. 2万亩，年产苹果、梨8500余吨，其中外销5000余吨。引进安徽砀山的贡梨，经过人工培育，优于原产地，色泽金黄，香脆多汁，年产4000余吨，深受香港、新加坡、加拿大人民的欢迎。年末牲畜存栏数为346844头（只）。
  全师按地域和生产项目，分为三个农业灌区、二个山区牧场。
  小海子灌区小海子灌区位于巴楚县东南67公里处的叶尔羌河下游洪积平原上。土地面积263.42万亩。灌区有四十四团、四十九团、五十团、五十一团、五十二团、五十三团等六个农牧团场和工程团、小海子水管处、劳改管理处、第二修配厂。灌区共有耕地50.62万亩，野生胡杨林12.7万亩，果园、林地3.82万亩，甘草13万亩。五十三团生产的松树牌甘草膏，远销欧美、日本、马来西亚等国。罗布麻4万亩，可放牧的林地45万亩。尚有可耕荒地88.16万亩。水利工程有小海子、永安坝南北二库，年蓄水能力8.4亿立方米。水面245平方公里。是兵团规划重点开发的垦区。1986年底，人口为82963人，少数民族占63.5%。六个团场1988年工农业总产值6639.8万元，粮食总产18700吨，缴售国家6988吨。棉花总产6488吨，上缴6684吨。
  灌区附近的脱库孜萨来依古城，就是唐代屯军的遗址。
  麦盖提灌区该灌区位于麦盖提东北27公里处的叶尔羌河中游冲积平原。
  总面积为132.99万亩。区内有四十三团、四十五团、四十八团、其克里克农场等团场。现有耕地14.61万亩，人口23214人。1988年工农业总产值4903万元。粮食总产12038吨，缴售国家5677吨。天然胡杨、红柳13.03万亩，果园林带19.6万亩。是1966年新开辟的垦区。前进水库管理站驻在这一灌区。近年积极推广绿肥轮作、良种、模式栽培、地膜覆盖等一系列新技术，棉花单产逐年提高。1988年经全国棉花协会组织专家鉴定四十三团八连35亩陆地棉，亩产170.9公斤，创全国陆地棉亩产最高纪录。四十三团和四十五团4万亩棉花连续3年亩产皮棉100公斤以上。全灌区1988年产棉6078吨，缴售国家6633吨。
  喀什灌区该灌区位于喀什市、疏勒、疏附、阿克陶、伽师、岳普湖、阿图什、英吉沙等县境内。驻有四十一团、四十二团、伽师总场、东风农场、红旗农场、莎车农场等6个单位。人口19488人。现有耕地面积15.85万亩，天然胡杨、红柳18.52万亩，果林2.81万亩，尚有可耕地49万亩。1988年工农业总产值20175万元（1980年不变价）。产粮8330吨，产棉1694吨。缴售国家粮食3255吨，产棉花1611吨。伽师农场的“伽师瓜”，皮薄瓤厚，香甜可口，耐贮运，年外销2000余吨，畅销区内外。驻喀什市的有建筑公司、运输公司、师直属单位，驻莎车县有一修厂。
  山区牧场，包括叶城县的二牧场和乌恰县的托云牧场。土地规划面积108.44万亩，草场99.15万亩。耕地0.29万亩。1988年牲畜存栏头数22948头（只），有人口1778人。