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第五條本會對上下級的關係規定如左：（一）本會對於主管範圍內之重要工作，於處理後報告政務院，對於有全國性影響的工作，事先向政務院請示，事後報告。
   （二）轉發中央人民政府和政務院對全國各省（市）縣（市）的通今，公告及對某一省（市）的工作指示，轉鞭各省（市）縣（市）向中央人民政府和政務院的請示、請求。
   （三）本會及所屬各委、部、會、院、署、行、局等機構得就業務與技術範圍向中央各委，部、會、院、署、行請示、請求。
   （四）本會各委、部、會、院、署、行、局得根據已定政策、方針就業務與技術的指導範圍內行文致各省及直轄市人民政府，或及其所屬各廳、行、局、處、會等機構。省及直轄市人民政府，或及其所屬各廳、行、局、處 、會等機構，亦得就同樣範圍內向本會各有關部門請示、請求，但本會各委、部、會、院、署、行、局與各省及直轄市各廳、行、局、處、會等機構之間的行文如涉及全盤性者，均應抄送各省及直屬市人民政府。
  （五）本會對各縣（市）的通今、公告及對某一縣（市）的工作指示均由各省人民政府轉發，各縣（市）的請示、請求亦由各省人民政府轉報，關於某一特殊問題之詢問與答覆，本會與縣（市）亦得直接令、報，但同時抄送各省人民政府。