孔昭同奉命率部赴部东,开展地方工作,扩大抗日根据地。在部东地区,遭到了土顽申宪武的突然袭击。重病中的孔昭同,在担架上强支身体,指挥应战。血战两日,在一一五师主力部队的支援下,击溃了顽军。
邹东战斗后,孔昭同病情恶化,被送到一一五师卫生院抢救。他感觉病势沉重,唤儿子宪绍到病床前,谆谆告诫他要继其遗志,在共产党八路军的领导下,抗战杀敌,为国尽忠。他命人写下遗嘱:“前线全体同志公鉴:吾自抗战以来,将近二载,意欲上尽国忠,下报家仇,以成伟大之事业;不意我身染不治之病,危在旦夕,使我未成之业,中道而止。此乃我终身之憾事也。犬子绍,年幼无知,恐亦难继吾志。惟望各位,和衷共济,协同杀敌。吾在九泉亦瞑目矣!切切此嘱!”嘱罢而逝,终年60岁。