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构成当代汉族尹姓主要有五大支：少昊氏、姬姓、兮姓、姒姓和外族的改姓。
  第一支系出少昊氏。黄帝之子元枵，亦作玄嚣，即少昊（少皞），是黄帝与方雷氏所生之子，名挚，初号青阳氏，己姓。少昊继承黄帝之帝位，以五行之首金统治天下，世称其有金德，故号金天氏，改为嬴姓，为东夷族联盟的首领。出自少昊氏的尹氏有两分支：其一以邑为氏。少昊之子殷，任工正之官，封于尹城，故城在今山西隰县东北，其后以邑为氏。其二以官为氏。少昊之后裔寿，为尧之师，位师尹之职，其后以官为氏。嬴姓尹氏至少有4000多年的历史。
  第二支出自姬姓。西周初所封姬姓国有尹国，子爵，为周畿内国，在今河南宜阳西北、新安东北，尹国君主一直为周卿士，后来国灭，地属郑国，子孙以国为氏。姬姓尹氏有3000年历史。
  第三支出自兮姓。西周宣王时吉甫为师尹，师尹位于太师、太傅、太保三公之首，商、西周为辅弼之官，子孙遂以官为氏。尹吉甫，原姓兮，名甲。兮姓尹氏也有2800多年的历史。
  第四支源出姒姓。夏朝时，夏人并吞了山西临猗县西的嬴姓沈国，建立了姒姓沈国。商朝时，姒姓沈人南迁于河南固始之寝丘立沈子国。西周初，蒋国灭姒姓沈国，国君沈子逞南逃楚地的沈鹿，今湖北钟祥东的大洪山之麓，为楚国一邑，为楚令尹，其后以官为氏。
  第五支出自外族的改姓。尹姓的起源不止以上四大支，加入尹姓大族的最重要的内容是少数民族的成分，尤其西南地区的尹姓。历史上发生的外族融入尹姓群体的重要事件有：西汉初期的西南贵州牂牁大姓尹姓，属夜郎族，桓帝时其族人尹珍为荆州刺史；东晋末巴蜀僚族中也有尹姓；宋朝时西羌族也有尹姓；明清时期西南地区的土著汉化加速，尹姓是其中一部分。东北地区的尹姓可能出自朝鲜人，尹姓为朝鲜人的大姓。