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董姓的起源主要有三大支，董姓、姒姓和外族的改姓。
  第一支出于董姓。源头可以追溯到黄帝之裔高阳氏颛顼帝。据说颛顼有子名称，称氏族居今河南东南的汝河地区。称之子老童，老童之二子黎、吴回在高辛氏时代先后任祝融氏。吴回氏始居陕西陇县，夏朝时东迁山西平陆之吴山。吴回之子陆终，陆终有六子，后分别发展为六个大部落。陆终的第二子惠连，亦名参胡，董姓。
  惠连氏族是一支擅长制草绳的部落，董便是能制绳索的〓草，惠连氏族以董为图腾，活动于今太行山南侧。惠连之子飂叔安，飂叔安之子为帝舜豢养龙，龙即鳄鱼之古名。帝舜封飂叔安之子于董，称董父，氏称豢龙氏。董的古址在今山西闻喜县东北，是夏商时代的侯国，临近其父祖居地山西平陆的吴山，后来为晋国所并。董姓的历史至少有4000多年。
  第二支出自姒姓。大约公元前2070年，禹建立了夏朝，姒姓。禹后为夏王启，夏王启封其庶子于莘，今陕西合阳东南。辛、莘古代通用，其后有辛氏。进入西周，其后裔世代为周朝史官，辛甲是周武王的太史，至东周襄王（公元前651－前619年在位）时期有周大夫辛有，辛有之子到晋国任史官，自此以后，晋国有史官之职，其封地在原董国故地，后裔遂以董为氏，成为晋国旧贵族11姓之一。姒姓董氏的历史有2600多年。
  第三支来自外族的改姓。自汉至唐，云贵地区的董姓已成为大姓，云贵地区的土著董姓后来逐渐同化为西南地区的汉族。据说早在先秦时期，董姓已经向西和向南移民，进入了甘川滇黔广大地区，与当地土著混居，董姓融入进当地的土著之中，成为土著诸姓之一。因此，我国的董姓同其他姓氏一样，不断与其他民族交流，互有基因的流动。加入董姓群体中的西南、南方和北方外族主要有：西汉初期的匈奴族、三国时吴国的山越族、晋朝时的氐族、南北朝北魏时的羌族、唐朝吐蕃人的董部落、五代后梁时羌人、宋朝时的高句丽人等，清朝时满洲八旗姓董鄂氏、栋鄂氏、佟佳氏、珠赫勒氏等全体族人的改汉姓董，致使东北地区多董姓。这些少数民族与汉人长期混居，逐步同化而成为当地的董姓汉族。