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前文已指出，朱子在《集注》时期改变了以戒惧和慎独为涵养的观点，将慎独从涵养中分离出来，以戒惧为涵养，以慎独为省察，所以戒惧与慎独的关系也是涵养与省察关系的重要部分。在中晚年阶段，朱子延续了《集注》时期的讨论，继续对此前的修正做进一步的说明，多次提出自己“旧说”有误，如今已改定。
  所示诸说，似于《中庸》本文不曾虚心反复详玩，章句之所绝、文义之所指尚多未了，而便欲任意立说，展转相高，故其说枝蔓缠绕，了无归宿。……恭叔所论，似是见熹旧说而有此疑，疑得大概有理，但曲折处有未尽耳。当时旧说诚为有病，后来多已改定矣。大抵其言“道不可离，可离非道。是故君子戒慎乎其所不睹，恐惧乎其所不闻”，乃是彻头彻尾、无时无处不下工夫，欲其无须臾而离乎道也。又言“莫见乎隐，莫显乎微，故君子谨其独”，乃是上文全体工夫之中，见得此处是一念起处、万事根原又更紧切，故当于此加意省察，欲其自隐而见，自微而显，皆无人欲之私也。此是两节，文义不同，详略亦异。……前段即卒章所谓“不动而敬，不言而信”，后段即卒章所谓“内省不疚，无恶于志”，文义条理大小甚明，从来说者多是不察，将此两段只作一段相缠说了，便以戒慎恐惧、不睹不闻为谨独，所以杂乱重复，更说不行，前后只是粗瞒过了，仔细理会，便分疏不下也。①
  由引文可知，朱子认为胡季随对《中庸》文本没有反复琢磨，对其中章句、文义的意思没有了解透彻，所以其说过于枝蔓缠绕。朱子此处提及潘恭叔似乎看到朱子“旧说”而产生疑问，肯定其疑惑得有道理，但在一些转折的地方还没有把意思表达出来。朱子认为“旧说”诚然有问题，但后来大多已经改定了。大致上说《中庸》中的戒慎工夫是彻头彻尾、无时无处不下的工夫，而谨独是在一念起处开始的省察工夫。可见朱子明确将戒惧和慎独阐释为持敬和省察。朱子进一步提出戒惧和谨独两节的文义不同，详略也不同。前段所说“戒惧”是“不动而敬”的“敬”，后段所说的“谨慎”则是“内省不疚”的“省察”，文义条理都已十分明白。朱子解释说因为没有好好体察其中的分别，结果将两段工夫混为一段工夫缠绕地说，把戒慎恐惧理解为慎独，所以会出现杂乱重复的说法。朱子此处说“从来说者多是不察”将两段工夫缠绕地说，是与开头其批评胡季随对《中庸》的理解枝蔓缠绕相互呼应，显然胡季随的问题在于混淆了戒惧和慎独的工夫，将戒惧和慎独都理解为涵养而没有认识到慎独是省察的工夫。
  同年，朱子又致信胡季随，在信中引用了多种关于戒惧和省察关系的观点，并做了点评，如潘恭叔说：“戒惧者，所以涵养于喜怒哀乐未发之前。慎独者，所以省察于喜怒哀乐已发之后。”②朱子对此认为：“此说甚善。”可见朱子以戒惧为涵养工夫以慎独为省察的思想十分明确。对林一之所说：“戒惧乃所以慎独也，涵养省察之际，皆所当然，未发之前，不容着力，只当下涵养工夫。来教得之。‘省察于已发之时’，此句之病，恭叔已言之矣，正所以存天理、遏人欲也，恐不可分。”①朱子提出：“作两事说，则不害于相通；作一事说，则重复矣。不可分中却要见得不可不分处，若是全不可分，《中庸》何故重复说作两节？”②在此，林一之提出戒惧是慎独工夫的原因，戒惧和慎独不可以分开，但朱子认为戒惧和慎独分为两个工夫不影响二者互相贯通，如果作为一件事来看，则重复了，应该从不可分中去理解二者不可以不分开的地方在哪里，如果二者真的不可以分开，那《中庸》没必要重复将戒惧和慎独作两节说。在此，朱子强调要将戒惧和慎独分为两个工夫来认识，但又要看到两个工夫的相通之处，胡季随说：“戒谨、恐惧、慎独，统而言之，虽只是道都是涵养工夫，分而言之，则各有所指。独云者，它人不知己所独知之时，正友恭所谓‘已发之初’者。不睹不闻，即是未发之前，未发之前无一毫私意之杂，此处无走作，只是存天理而已，未说到遏人欲处。已发之初，天理、人欲由是而分，此处不放过，即是遏人欲，天理之存有不待言者。如此分说，自见端的。”③朱子对此回应说：“此说分得好，然又须见不可分处。如兵家攻守相似，各是一事，而实相为用也。”④胡季随认为虽然戒惧和慎独都属于涵养工夫，但二者有分别，戒惧的工夫是未发前没有私意出现的时候，还没有开始做遏止人欲的工夫。但慎独的工夫是在已发后，是遏止人欲的工夫。朱子认为胡季随分说得极好，但也要看到他们不可分的地方，二者不可分的地方就像兵家的攻守工夫，各是一个事情却互相配合使用，互相贯通，戒惧是慎独的前提，同时戒惧行于慎独之中，而慎独又是戒惧的助益，这与朱子阐述持敬与省察的关系是完全一致的。也可以看出，朱子中晚年时期言涵养与省察的关系，更多地从做工夫上进行分析，言二者之分，也言二者之合，此后朱子更注重言持敬与省察之合，这个变化应该是从57岁开始的。
  1186年朱子在《答胡季随》①中说潘恭叔似乎是看到自己之前的“旧说”而产生疑问，当时的“旧说”确实有问题，但后来大多已改定。对朱子所言的“旧说”，朱子在同年与潘恭叔的通信中同时言及对省察的认识和对《集注》的修改，由此可知此“旧说”应是朱子在《集注》中对涵养与省察关系认识的变化，朱子对潘恭叔说：“示喻为学之意，甚善。然不须如此计较，但持守省察，不令间断，则日用之间不觉自有得力处矣。……近年读书，颇觉平稳不费注解处意味深长，修得《大学》《中庸》《语》《孟》诸书，颇胜旧本。”②此处，朱子将持守省察合说。同年，朱子又说：“学问根本，在日用间持敬集义工夫，直是要得念念省察，读书求义乃其间之一事耳。旧来虽知此意，然于缓急先后之间终是不觉有倒置处，误人不少，今方自悔耳。”③“持敬集义”即持敬省察，朱子在此强调省察，认为读书求义只是省察中的一件事，可见朱子此时已经开始强调省察，晚年后朱子对省察又有进一步的重视。