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1989—2008年，南安调整经济结构，探索多种所有制形式共同发展的新途径，民营经济逐渐取代国有集体经济，成为经济发展的主体。在企业所有制结构、劳动就业结构、三次产业结构和投资结构等方面，出现深刻变化，形成新格局。
  第一节 企业所有制结构
  一、农业企业所有制结构
  1989年，农业企业只有国营企业和集体企业两种，国营企业由国有农林场和政府部门农业服务单位组成，集体企业由乡办、村办集体企业或个人办挂靠集体企业组成。
  1990年后，深化农村经济体制改革，实行农业综合开发，发展农村多种经营，乡办、村办的集体农业企业大多数实行改制或由个人承包经营，联户办、合伙办、个人办的农业企业以及规模较大的私营农业企业迅速增加，同时还引进港澳台资创办亚热带水果种植、渔业养殖企业等。
  1996年、2006年开展的第一、二次全国农业普查资料表明，全市农业企业经济类型结构发生明显变化，国有企业、集体企业因改制或承包经营，所占比重下降；股份制合作企业、私营企业及港澳台资农业企业大量增加，所占比重上升。
   二、工业企业所有制结构
  1989年，南安县的工业企业以国营、集体企业为主，两者所占比重为79.19％。
  1990—1995年，部分国有（国营）、二轻工业企业实施改组改制或破产关闭，企业单位数减少，所占比重下降；乡镇工业、三资工业、私营工业和个人合伙工业大量开办，所占比重大幅度提高，工业经济形成多种经济类型共同发展的新格局。
  1996—2000年，全市新开办工业企业3360家，其中私营企业、股份制合作企业占有9成多的比重。
  2004年、2008年开展的第一、二次全国经济普查的资料表明，全市3000多家工业企业中，国有、集体企业所占比重均在1.5％上下，三资企业所占比重稳定在8％上下，私营企业、股份制合作企业则占有90％以上的比重。
  三、商贸企业所有制结构
  1989年，全县商贸企业都是国营企业或集体（合作）企业。
  1990—1992年，国营、集体商业企业实行兼并重组、拍卖关闭等形式的改革改制，企业单位数从188家减少到46家，新组建股份制合作企业、合伙企业参与商业经营。全市商贸企业中，国有、集体企业仍占有7成多的比重，新组建的股份制合作企业所占比重不足3成。
  1993年后，随着市场的进一步开放，联营、股份合作、私营、个体经营等类型的商贸企业大量出现，各类商品市场、各种新型经营业态进入市场。
  2004年、2008年开展的第一、二次全国经济普查的资料表明，国有集体商贸企业所占比重仅有1—2成，私营企业和股份制合作企业所占比重有8—9成，港澳台资经营的商贸企业所占比重极少。
  第二节 劳动就业结构
  1989年，南安是农业县，70.50％的从业人员在第一产业就业，13.71％和15.79％的从业人员在二、三产业就业。三次产业就业比重的排序为一、三、二。
  1990—1993年，乡镇企业、三资企业迅速发展，工业、商业、建筑业、交通运输业、服务业等非农业企业单位大量增加，大批农业从业人员转移到非农业企业单位务工经商，第一产业就业比重下降，二、三产业的就业比重上升。1993年，三次产业劳动就业结构为57.47：21.18：21.35，与1989年相比，第一产业下降了18.24个百分点，第二产业上升了13.84个百分点，第三产业上升了4.4个百分点。三次产业就业比重排序仍为一、三、二。
  1994年，全市在第二产业（工业、建筑业）就业人员的比重22.89％，在第三产业就业的比重为21.68％，第二产业就业比重首次超过第三产业。三次产业就业比重排序为一、二、三。
  2000年，从业人员在第二、三产业就业的比重上升到50.49％，首次超过第一产业就业的比重。
  2004年开展第一次全国经济普查的资料表明，第二产业的从业人员比重52.78％，首次超过一、三产业之和。三次产业就业比重排序为二、三、一。
  2006年开展的第二次全国农业普查的数据表明，当年全市常住从业劳动力670022人，其中外地流入的从业劳动力125231人（省内34951人，省外89670人，港澳台及国外342人），南安市转移外出的从业劳动力198841人（乡外省内110857人，省外85811人，港澳台及国外2173人）。劳动力流出比流入多73610人。
  2008年开展的第二次全国经济普查的数据表明，当年全市从业人员774284人，其中在第一产业就业127119人，占比16.41％；在第二产业就业468421人（其中工业414102人），占比为60.5％；在第三产业就业178744人，占比23.09％。三次产业的就业比重排序为二、三、一。
  附：2006年南安市乡村劳动力从业情况
  一、乡村常住从业劳动力数量
  根据第二次全国农业普查规定，南安市乡村是指农村乡镇中的393个村（居）委会，不包括城镇街道办事处所属居委会。 2006年，全市有乡村户籍劳动力833335人（其中整劳动力735641人、半劳动力97694人），常住从业劳动力670022人。
   （一）三次产业从业人数
  第一产业115444人（男38586人、女76858人），占劳动力总数的17.23％，其中种植业106537人、林业776人、畜牧业5252人、渔业2136人、农业服务业743人。按从业人员户籍地分，在村内113889人、村外乡内288人、乡外县内164人、县外地（市）内142人、市外省内269人、省外680人、港澳台7人、国外5人。
  第二产业389947人（男198385人、女191562人），占58.2％，其中采矿业4180人、制造业322573人、电力自来水生产及供应业4224人，建筑业58970人；
  第三产业164631人（男99754人、女64877人），占24.57％，其中交通运输业22014人、批发零售业51074人、住宿餐饮业7619人、居民服务业50071人、其他行业33853人。
  （二）各就业方式从业人数
  在家庭户中就业573961人，其中雇主7734人，家庭帮工5836人，自己经营206270人，务工347828人，公职人员6293人；在集体户中就业96061人。
  二、外出（外来）从业劳动力从业情况
  外出（乡镇以外）从业劳动力合计198841人（男124277人、女74614人），其中省内110857人，省外85811人，港澳台及国外2173人。外出人员中，从事第一产业6066人（男3787人、女2279人），其中种植业431人、林业426人、畜牧业1105人、渔业3834人、农业服务业270人；从事第二产业107948人（男63960人、女43988人），其中采矿业1185人、制造业89949人、电力自来水生产及供应业1591人，建筑业15223人；从事第三产业84827人（男56480人、女28347人），其中交通运输业6751人、批发零售业49801人，住宿餐饮业3317人、居民服务业15597人、其他行业9361人。
  外地（乡镇以外）流入的从业劳动力125231人（男75705人、女49526人），其中省内34951人，省外89670人，港澳台及国外342人。
   第三节 三次产业结构
  1989年，南安生产总值（GDP）9亿元，其中第一产业增加值3.52亿元，占有比重39.11％；第二产业增加值3.09亿元，占比34.33％；第三产业增加值2.39亿元，占比26.56％。
  1992年，乡镇企业、三资企业蓬勃发展，第二产业增加值所占比重大幅度提高到43.73％，首次超过第一产业并高出10.49个百分点。
  1993年，第二产业增加值比重首次超过50％。
  1997年后，南安市持续开展工业立市、工业强市系列活动，第二产业增加值持续增长。
  2001年，第二产业增加值比重上升到55.92％，第一产业增加值比重首次下降到个位数（9.78％）
  2005年，第二产业增加值比重突破60％。
  2008年，三次产业的增加值比重结构为4.77：62.21： 33.02。
  第四节 投资结构
  1989年，全县完成固定资产投资额16600万元，比上年增长21.8％。投资主体是国有、集体的行政单位和企业事业单位，投资项目主要是基本建设和企业技术改造，投向第一、三产业的资金多于第二产业。资金来源以投资项目单位自筹为主，财政资金和银行贷款投入很少。
  1992年，实施乡镇企业发展工程、基础设施建设工程和大市区建设工程，全县国营、集体单位完成固定资产投资额33463万元，比上年增长120.7％，投资额和增长速度均创历史新高。在投资总额中，二产的工业投资额占55.41％，三产的交通邮电、商业外贸、文教卫生、公共事业等投资额占43.19％，一产的农林水投资额占1.4％。
  1995年，贯彻执行国家投融资体制改革的有关规定，基础性、公益性建设项目投资增加，非生产性项目投资严格控制。全市实施10个方面40个重点建设项目，完成固定资产投资总额158305万元，其中国有单位的投资额占4成多，集体单位投资额占近3成，个人投资额不到2.5成。国有、集体单位投资仍居主导地位。
  1996—1998年，投资重点放在工业支柱产业的骨干项目以及港口、道路、通信、供电、城市建设、科教文卫等二、三产业项目。
  2000年，全市投入基础设施和工业园区的资金大量增加，房地产开发投资迅速增长。近百个投资项目完成投资额276625万元，比上年增长14.5％，其中，一产项目投资额9206万元，占3.33％；二产项目投资额89463万元（其中33个工业重点项目投资额42842万元），占33.34％；三产项目投资额177956万元（其中新村建设投资和房地产投资共3.13亿元，比上年增长8.4倍），占64.33％。
  2005年，市委市政府出台《关于进一步推进民营经济发展的若干意见》，进一步放开投资领域、降低投资门槛，允许民营资本进入基础设施、市政设施、公共交通、环境保护、园林绿化、文化教育、医疗卫生、旅游开发以及非基本公共服务等行业；规划建立8大工业基地园区，培育工业龙头企业。当年完成固定资产投资额514725万元，比上年增长20.46％，投资结构中二产工业项目占58.82％，为历年最高水平。
  2006—2008年，持续开展“招商引资项目落地”“回归创业工程”等工作，规范政府投资项目管理，采用BOT、TOT形式融资，吸引国有资本、民营资本、外商资本投向基础设施和二、三产业的大项目，推进工业化、城镇化建设和社会事业的发展。2008年，全市完成固定资产投资额951916万元，其中二产工业项目完成投资额524540万元，占55.10％；三产（基础设施、城镇建设、市场物流、旅游开发、房地产小区、社会事业等）项目完成投资额420059万元，占44.13％；生态农业（含防洪工程、清洁家园等）一产项目完成投资额7317万元，占0.77％。