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赤潮大体可分为外来型和原发型两大类。
  外来型赤潮通常是该赤潮生物在营养丰富的上升流区大量繁殖，尔后，在风、浪、流等物理因素的作用下，聚集于某地并发生危害。闽北一带经常出现的束毛藻赤潮大多是由此形成，故当地称其为“东洋水”或“东洋涨”。
  原发型赤潮的成因极为复杂，既有各种不同赤潮生物各自的生物、生态需求，又有不同海区的物理、化学、气象的环境因素，因此，赤潮的发生机制至20世纪末尚未完全探明。仅就环境因素而言，主要的如图5-12所示，其中，海域的有机污染，水体富营养化是赤潮发生的物质基础，已被普遍共识。此外，地形的半封闭性、水体交换条件差，以及适宜的温、盐、光等条件也是重要原因（应指出，各不同赤潮生物对温、盐、光的需求不同）。