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一、内资企业
  1996年，全省内资企业年检率偏低，主要原因有两个：一是部分企业依法年检意识不强，经营较好，就参加年检，否则就不参加年检；二是有相当一部分上年度未办年检的企业已名存实亡。全省年检内资企业181452户，占应检企业总数的85.39%。其中，企业法人应检126436户，实检108483户，经营单位应检86059户，实检72969户。全省连续两年不参加年检的企业达5831户，占当年无正当理由不参加年检企业数的26.2%。全省年检企业注册资本（金）为11642245万元，实际到位资本（金）11694186.96万元，到位率100.45%。
  1997年，工商行政管理机关在年检中以A、B级区分企业类别，鼓励企业遵纪守法，警示和约束违法违规企业，继续做好“三无”企业清理工作。当年共年检企业法人和经营单位171604户，年检率81.73%。其中，企业法人应检125736户，实检101355户，经营单位应检84237户，实检70249户。年检企业注册资本（金）13244347.81万元，实际到位资本（金）13633799.31万元，到位率102.94%。查出擅自改变登记事项企业1418户，查无下落企业2168户，连续两年不参加年检企业5831户。473户企业被划定为B级。
  1998年，全省工商行政管理机关结合亮照经营大检查，纠正擅自改变登记事项企业1399户，同时结合年检解决企业经济性质不清、产权关系不明晰等问题。全省共办理企业年检163672户，年检率82.08%，其中企业法人应检119612户，实检97138户，经营单位应检79786，实检66534户。年检企业注册资本（金）1489“7342.74万元，实际到位资本（金）15561383.46万元，到位率104.46%；资产总额70285348.66万元，负债总额39303431.72万元，税后利润1313751.87万元。被警告、责令改正和停业整顿企业有544户，吊销营业执照3934户，被划定为B级的企业1569户。
  1999年，各级工商行政管理机关落实中央关于军队、武警和政法机关不再从事经商活动的决策，通过年检帮助军队、武警和政法机关所办企业办好脱钩手续；按照国务院关于粮食流通体制改革的部署，对粮食收储企业重新规范；继续运用职能，支持国有企业深化改革。5月，省工商局印发《企业免检制度试行办法》，规定免检企业条件。省工商局要求各地把国有企业作为免检企业的首选对象。厦门市工商局确定48户国有企业为1999年度和2000年度免检企业。南平市工商局为21户被确定为1999年度和2000年度免检的企业颁发免检证书。全省应参加年检内资企业170278户，其中法人企业100038户、营业单位70240户；实际参加年检139661户，其中法人企业80752户、营业单位58909户，年检率82%。年检合格企业136310户，其中法人企业78845户、营业单位57465户，合格率为98%。全省共发现“三无”企业3163户、隐瞒真实情况弄虚作假企业127户、登记注册后6个月至一年未经营的企业1060户、虚假或抽逃出资企业56户、注册资本（金）不到位企业1483户。全省共注销企业5608户，划定B级企业1372户，被处以警告的企业455户，责令停业整顿企业173户，吊销营业执照企业6032户，处以罚款企业1144户，罚没款总额133万元。
  2000年，工商行政管理部门结合年检对涉及前置审批的烟花爆竹、药品等特殊行业的企业实施“回头看”，对证件不全或超过有效期限的进行规范；配合当地政府部门搞好小煤矿、小炼油、小钢铁、小水泥等企业的清理整顿工作。各级工商行政管理机关以扶持国有企业、服务经济发展为主导，开展电话预约、加班受理、上门年检、继续推行免检制度等活动。全省应检内资企业153751户，实检127976户，参检率83.24%。注册资本（金）总额1427.16亿元，实际到位注册资本（金）1544.26亿元，到位率108.2%。免检企业400户。对注册资本（金）不到位或虚假、抽逃出资，弄虚作假，擅自改变登记事项，超范围经营以及“三无”企业共2283户分别给予警告、罚款、停业整顿、吊销营业执照等处理。全省共关闭“八小”企业152户，吊销营业执照3450户，划定B级企业960户。
  2001年，根据国家工商总局关于企业年检实地检查企业不低于登记注册数20%的规定，全省工商行政管理机关实地检查企业39893户，占企业总数的29.9%。省工商局于当年12月25日在福州召开2001—2002年企业年度检验免审发布会，授予32户在省工商局登记注册的遵纪守法、信誉度高、经营状况良好的国有大中型企业年度检验免审资格。全省共有336户企业被各级工商局确定为年检免审企业。全省应检内资企业133307户，实检109652户，参检率82.26%，其中年检合格104944户，合格率95.71%。年检注册资本（金）15779980万元，实际到位资本（金）15805553万元，到位率100.16%。
  2002年，各级工商行政管理机关严格前置审批审查制度，重点加强对关系人民生命财产安全企业的年检工作。全省重新规范企业登记前置审批手续20715户，其中督促企业补齐前置审批材料15078户，办理变更登记4103户，注销登记769户，依法吊销营业执照765户。全省共实地检查企业66911户，实地检查率达70%。全省应检内资企业126591户，实检97587户，年检率77.11%。年检注册资本（金）1640.4亿元，实际到位资本（金）1768.8亿元，到位率107.83%。年检合格企业95450户，合格率为97.8%。
  2003年，为方便企业年检，做好“非典”防治工作，省工商局及时作出全省年检截止期限从原来的4月30日延长至6月30日的规定，北京、广东和山西等疫情较重地区企业在本省设立的分支机构，年检时间延长至9月30日；还规定各级工商行政管理机关可采取电话预约、信函预约等方式为企业办理年检，纸质材料允许待后补交。11月，省工商局发布《福建省工商局关于实行企业网上年检服务办法》，规定企业可根据《年检报告书》内容将相关材料网上发送至工商行政管理机关。受理机关查看信息并进行初审，发现有问题的，网上通知企业补充材料；基本合格的，网上通知企业到机关办理手续。当年全省共年检内资企业82384户，参检率78.31%。年检注册资本（金）1900.5亿元，实际到位资本（金）1923.4亿元，到位率101.2%。省工商局共授予661户企业年度免审资格。
  2004年，省工商局规定企业年检时间每年从原来1月1日至4月30日延至5月31日；实行信用企业两年一次年检；“守合同、重信用”企业与获同级政府以上荣誉称号的企业当年可免于年检审查；除外资企业外，在省工商局与设区市工商局登记的信用企业委托企业所在地的县（市、区）工商局年检；在县（市、区）工商局登记的企业委托企业所在地工商所年检；企业可从网上下载年检报告书等材料和从网上传送年检材料，工商行政管理部门进行网上年检。当年，有13530户企业在延长1个月年检期限内办理年检，占应检企业总数的14.66%，有18427户企业获得免审资格，以委托年检方式年检企业23610户，占应检企业总数的25.57%。全省共清理相关企业3213户，变更登记3016户，注销登记187户；结合年检检查房地产开发公司635户，立案7户。全省应检内资企业92321户，实检69312户，年检率75.08%，其中企业法人应检49755户，实检37935户，经营单位应检42566户，实检31377户。年检企业注册资本（金）19874311.6万元，实际到位资本（金）1“31966万元，到位率100.29%。
  2005年，省工商局组织开展集中委托年检活动，指定兴业银行股份有限公司、中国建设银行股份有限公司、中国农业银行等8家企业为改革试点单位。省工商局下发内资企业年检若干问题的通知，就年检工作的重点和进一步改革年检办法作出规定。当年通过“网上年检申报”参检的企业达7579户。全省应检内资企业92005户，实检71396户，参检率77.6%。二、个体私营企业
  1996年，全省工商行政管理部门根据省工商局关于做好个体工商户验照和私营企业年检工作的要求，做到验照年检与法律法规政策宣传、查处违章违法行为、取缔无照经营、日常监督管理“四结合”，达到规范个体工商户经营行为与私营企业主体资格行为“两规范”。全省个体工商户（含个人合伙）应验照户为645360户，实际验照户数为533191户，验照率为82.6%；未验照户150627户，占应验照户数的23%。其中，歇（停）业105060户，吊销营业执照785户，其他原因未参加验照44827户。全省私营企业（含有限责任公司）应年检数25219户，实际年检20962户，年检率为83%。
  1997年，全省经登记发照的个体工商户542516户，办理验照贴花准予继续开展生产经营活动的个体工商户506176户，占发照总数的93.3%，其中停歇业63699户，吊销营业执照4983户，未验照35980户。全省经登记注册的私营企业（含以自然人为主投资设立的有限责任公司）28833户，年检22074户，占发照总数的76.6%，其中变更登记644户，重新登记572户，注销2800户，吊销营业执照783户。
  1998年，全省在年检中共查处无照经营19785户，限期补办15157户，取缔1506户；年检与查处违章违法案件相结合，共处罚违章违法、制售假冒伪劣商品案件56起，没收非法所得37万元；年检与补收个体管理费相结合，通过验照工作共补收个体管理费297万元。当年私营企业年检率较上年提高近4个百分点，个体工商户验照率较上年降低8个百分点。个体工商户验照率缩减原因，包括：有的地区重新划分行政区域，原始统计资料交接不齐，上报数或与实际数不符；部分经营户验照意识不强，未按法定时间报送资料、参加验照；市场竞争激烈，部分经营户因自身经营不善亏损严重，自动歇业放弃年检；当年旧城改造和城镇创卫，拆除部分店面、摊点，导致一部分个体工商户歇业。全省个体工商户登记发照520635户，验照贴花准予继续生产经营445448户，验照率为85.56%；未验照贴花75187户，其中停歇业38369户，吊销营业执照4756户，其他原因未验照贴花32062户。全省私营企业登记注册（含以自然人为主投资设立的有限责任公司、股份有限公司）30190户，实际参检24194户，年检率80.14%，其中变更登记1801户，重新登记95户，注销登记2253户，吊销营业执照1427户。
  1999年，全省个体工商户经核准登记发照543993户，验照贴花并准予继续从事生产经营活动470151户，验照率86.4%；未验照贴花73842户，其中停、歇业36468户，吊销营业执照6194户，其他原因未验照贴花31180户。全省私营企业（含以自然人为主投资设立的有限责任公司、股份有限公司）经核准登记注册34017户，实际参加年检28076户，年检率82.5%，其中停业整顿371户，变更登记2914户，注销登记2021户，吊销营业执照2997户。
  2000年，全省个体工商户登记发照56.86万户，验照贴花继续开展经营活动42.19万户，验照率74.2%，未验照贴花16.68万户，其中歇业71879户，吊销营业执照5753户，其他原因未验照贴花69151户。全省私营企业登记注册3.94万户，实际参加年检3.193万户，年检率81%，其中吊销营业执照3036户，变更登记1655户，注销登记1412户。
  2001年，全省个体工商户登记发照45.4万户，办理验照贴花37.7万户，占应验照户数的83%；未验照贴花7.7万户，占17%，其中已歇业3.7万户，吊销营业执照7273户，其他原因尚未验照的3.3万户。全省私营企业登记注册4.58万户，年检3.72万户，占应检户数的81.3%；未年检8578户，占18.7%，其中已歇业未办注销2371户，吊销营业执照2418户。与上年相比，全省个体工商户验照率上升近9个百分点，私营企业年检率也有所上升。验照年检率上升的主要原因是，各级执法部门重视，宣传工作做得细，措施得力，服务到位，以及个体工商户和私营企业的经营能力、市场竞争力及法制观念不断增强。
  2002年，全省个体工商户验照贴花34.84万户，占应验照户数的78.4%，未验照贴花9.6万户，占应验照户数的21.6%，其中停业5.15万户，吊销营业执照3711户，其他原因未年检3.68万户。全省私营企业（含有限责任公司和股份有限公司）验照贴花4.3万户，占应验照户数的79.08%，未参加年检验照1.14万户，占应验照户数的20.12%，其中无正当理由未参加年检7817户，虚假、抽逃出资109户，歇业未办注销手续836户，其他原因未参加年检442户，吊销营业执照2037户。
  2003年，全省个体工商户验照贴花34.6万户，占应验照户数的77.86%，未验照贴花9.84万户，占应验照户数的22.14%，其中停歇业3.99万户，吊销营业执照5654户，其他原因未验照4.0万户。全省私营企业（含有限责任公司和股份有限公司）年检5.2丨万户，占应检企业79.7%，未检企业1.33万户，占应检企业的20.3%。其中无正当理由未参加年检11584户，虚假、抽逃出资7户，已歇业未办理注销登记手续595户，其他原因未参加年检10982户，责令停业整顿400户，吊销营业执照3694户，处罚437户，罚没总额2246.63万元。与上年相比，个体工商户验照率下降0.54个百分点，私营企业年检率上升1.62个百分点。
  2004年，全省611户私营企业获得年检免审资格。全省应检私营企业、个体工商户共524003户，实际通过验照年检394795户，总验照年检率为75.34%，未验照年检共129207户，占24.66%。其中，应检私营企业85256户，实际通过年检66835户，年检率78.41%，比上年下降1.29个百分点，未通过年检18421户，占21.59%；应验照个体工商户438747户，实际通过验照327948户，验照率74.75%，比上年度下降3.11个百分点，未通过验照110799户，占25.25%。2005年5月，省工商局下发的《福建省工商局促进和服务农村经济发展的若干意见》第一条第四款规定，对边远农村的个体工商户和企业实行现场验照。当年全省应年检验照的个体工商户、私营企业共558187户，实际通过年检验照429265户，年检率77%。其中有限责任公司年检率较高，为89%，个体工商户验照率相对较低，为74.2%。
  三、外资企业（含常驻代表机构）
  1996年，全省各级工商行政管理部门在外资企业登记工作中坚持做好“五个结合”，即年检与督促企业履约缴资相结合（通过年检，对缴资期限已届满、尚未缴足资本的企业，发出催缴资通知书，限期缴足）、年检与换发新照工作相结合（换照工作与年检工作同步进行，全省基本完成换照工作）、年检与办理变更登记相结合（对登记注册事项变动的企业，一律要求其办理变更手续）、年检与加强对会计师、审计师事务所的监督相结合（严格审查两所出具的报告，对出具不规范、不真实、不准确报告的中介机构予以警告，并责令作出检讨和修改，对故意出具虚假报告的，实行不信任通报制度，有效提高验资、查账报告质量）、年检与处理企业违章违法行为相结合（对逾期不参检的企业，给予通报和批评，限期补办，并予罚款教育，对连续两年不参检或严重亏损、名存实亡的企业坚决依法予以吊销，以提高外资企业整体质量）。同时，加强与海关、税务等部门合作，为外资企业办理注册登记提供方便。当年，全省应参检外资企业16527户，实际参检企业11680户，参检率为70.67%，实际参检企业中年检合格企业10939户，合格率为93.65%。
  1997年，各级工商行政管理机关采取多种形式提高外资企业参检率，部分地（市）以上门服务和现场办公的形式实地年检。当年全省外资企业历年累计出资率为49.47%，比上年增长3.84%。全省应参加年检的外资企业16846户，实际参加年检企业12344户，年检合格企业为11479户，全省外资企业参检率为73%，合格率为93%。
  1998年，省工商局针对注册资本不到位的外资企业，发出“催缴人资通知书”共2507份，经催缴到位的注册资本达5903万美元。全省外资企业年检到资率比上年增长3.84%。厦门、龙岩两市外资企业出资率分别比上年增长9.48%、8.61%。当时正面临东南亚金融危机，省工商局规定凡1997年登记的企业其投资者系东南亚国家的，年检时缴资期限适当放宽。全省共有13718户外资企业参加年检，占应参检企业的74.79%，其中12959户企业通过年检，年检合格率为94.45%。
  1999年，全省各级工商行政管理部门对外资企业实行集中在工商大楼以工商年检为主的联合年检。当年受亚洲金融危机影响，外资企业出资率有所下降，全省外资企业实际出贤203189万美元，占年度应出资313313万美元的65%，比上年同期下降5%。2000年，省工商局主动邀集有关部门召开联合年检协调会议，并以省工商局为主拟制发布联合年检公告，为省工商局和省对外贸易经济合作厅等八部门联合年检工作做准备。漳州市工商局大部分县市及开发区均实行现场年检办公，共办理835户外资企业年检，占应参检企业数的60%，其中90%以上企业当场办好年检手续。
  2001年，省工商局在上年度实行营业执照复印件缴资公示制度基础上继续推行实缴资本公示制度。对未按合同章程按期缴足注册资本的企业，由登记机关根据企业实际出资状况，在其营业执照注册资本一栏上注明实收资本数额，对社会作出公示，以增加其注册资本的真实性和透明度。全省外资企业实际出资率有所提高，历年累计到资率为81.05%。
  2002年，各级工商行政管理机关根据国家工商总局和公安部关于整顿规范公司出资行为的通知要求，在年检期间，对外资企业出资履约情况实行“四个核查”：查企业是否按照章程、合同规定期限按期履约缴资；查已出资企业出资方式是否符合章程、合同规定；查以固定资产投资的企业投资者是否已办理财产转移手续；查已全部到资企业实有资本与注册资本是否一致，是否有抽逃和虚假出资迹象。对长期未出资，无法提交延期出资审批文件，又不办理减资手续，且生产经营情况较差的企业不予通过年检；对虚假出资等违法违规行为予以坚决查处。当年全省外资企业累计到资率82.88%，较上年增长1.83%。
  2003年，省工商局和省对外贸易经济合作厅等8部门召开联合年检工作会议，研究全省年检工作。各设区市普遍实行让基层工商局（所）参与外资企业年检工作的做法。全省应参检外资（法人）企业15563户，实际参检12852户，参检率为82.58%，较上年增长7.46%。
  2004年初，省工商局发布《关于实行企业网上年检服务办法》，在全省范围内推广网上年检。各设区市工商局指导基层工商所将辅助年检工作的重点放在前置审批审查、出资管理、促进安全生产和纠正违法违规行为上，加强基层工商所对企业年检的咨询指导。当年，外资企业参检率下降，企业出资情况、生产经营情况统计数字波动较大。全省应参检外资（法人）企业16404户，实际参检企业11983户，参检率为73.05%，较上年下降9.53%；年检合格企业10637户，合格率为88.77%；全省年检的外资企业应出资319056万美元，实际出资245608万美元，出资率为76.98%。
  2005年，全省试行“网上预审，一次办结”的年检工作模式以提高年检效率。省工商局重新设计开发全省统一、便于使用的网上年检软件并将其挂在“福建红盾网”上，方便企业实现网上年检申报自助操作。当年企业年检率上升，全省应参检外资（法人）企业17236户，实际参检企业13777户，参检率为79.93%；企业年检合格率也有所回升，年检合格企业12902户，合格率为93.65%；企业出资率也明显提高，全省年检外资企业应出资454314万美元，实际出资385556万美元，出资率为84.87%。