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审计工作业绩考核是审计计划管理的重要环节。其目的是检查既定的审计计划目标实现的程度，考察和评比目标承担者完成目标责任的实绩，以总结经验，肯定成绩，找出差距,表彰先进，鞭策后进，为确定和实现新的审计工作计划目标打下良好的基础。
  为了贯彻1987年7月全国审计局长座谈会精神，福建省审计局于10月组织第一次全省范围内的业务考核。省审计局对开展考核工作的目的、意义、内容、对象、标准及参加人员做了具体安排。本次考核的做法是：（1)以地市为单位，各抽调两名审计局长或地市审计业务科长，组成4～5个检查小组，由省审计局统一安排检查任务；（2)各地市推荐2～3个不同类型的县市审计局及本地市审计局作为调查、检查单位，地市自行安排的检查工作可以结合进行；（3)在全面工作检查中，侧重于审计业务方面，在审计业务检查中，突出审计工作质量；(4)调查的内容包括审计工作成果、工作特点、工作方法、存在问题及解决办法；(5)质量检查内容按照审计署提出的标准，省审计局补充要求有：审计结论和处理决定符合政策、法规和审计程序，不出差错；促进和帮助被审单位加强内部控制，改善经营管理，提高经济效益；在宏观控制和管理方面发挥作用；按照全省审计工作会议和定期普遍审计讲习会要求开展审计工作。重点检查审计单位分类、工作规划、方案制定、实施情况、档案管理、处理情况和工作效率。调查的方法为听取汇报，检查审计工作底稿，召集被审计单位座谈，听取当地党政领导意见，与检查审计的人员共同研讨等方式。审计检查工作于11月结束，向省政府、审计署做了汇报。
  1988年1月，福建省审计局根据审计署关于《1988年度审计工作考核有关问题的补充通知》的精神，结合本省审计工作的具体情况，部署全省审计业绩考核工作。省审计局组成由副局长温海树负责、有关处室负责人参加的考评小组。各地市县审计局由一位局长负责，指定一个职能机构具体抓。按照统一领导、分级负责的原则，省审计局负责考核各地市审计局，各地市审计局负责考核所属县市区审计局，省审计局给予必要的指导。本次审计工作考核的重点是审计机关的业务实绩。业务考核内容有年度项目计划完成情况、审计单位覆盖率、必审项目完成计划的比例、违纪金额应缴财政率、应缴财政已入库率、反映宏观经济情况的报告篇数、报告被批示或采纳率、审计决定落实率、审计统计情况、文书档案管理情况、审计自身建设。考评办法采取单项考评和综合考评相结合、定期考评和平时考察相结合，并采用百分制评分方式。15日，地市审计局完成对县级审计局的考评工作。16日，省审计局考评小组分赴各地市审计局进行考评，月底完成。2月，省审计局将考核工作情况总结上报审计署。
  1989年1月，福建省审计局下发《关于开展全省审计工作考核的通知》，从各地市审计局抽调审计局长或科长一名连同省审计局13人共22人组成4个组，分片对9个地市审计局和部分县审计局及省审计局各处室进行业务考核。本次考核工作重点是审计机关的业务工作实绩。考核内容有年度项目计划执行情况、违纪金额应缴财政入库率、反映宏观经济情况的报告篇数、反映宏观经济情况的报告被批示或采纳率、审计决定落实率、计划和统计报告编报及统计情况分析、综合材料报送情况、审计业务文书规范化、文书档案管理及审计程序执行情况、审计工作的社会效果，同时对审计队伍自身建设包括思想建设、审计体系建设、业务建设等情况综合考评。省审计局向审计署汇报了审计工作考评情况。
  1990年1月，福建省审计局对1989年度审计工作考核的内容和项目，除根据审计署的通知精神办理外，结合本省情况，增加以下两个方面内容：（1)考核“复审差错率”。即经复审发现原审计查出的主要问题与事实不符或主要审计结论和决定需要改变的单位数与复审单位数的比率，计算公式为：复审差错率=有差错的复审单位数/复审单位数×100%。（2)检查考核社会审计工作情况。其主要内容是审计机关建立社会审计组织、开展社会审计工作的指导思想是否端正，有无职能部门分管社会审计工作；审（报）批、监督检查、统计等管理制度是否健全，与审计事务所在经济上是否划分清楚；本管辖区域内审计事务所的工作人员数量、素质、办公场所、自有资金是否具备建所条件，财务管理制度是否健全，有无乱收费、乱开支等违反财经法规的现象；办理业务是否严格遵守依法审计、客观公正的原则，是否坚持为社会主义现代化服务、为改革开放服务的宗旨。
  同年，根据审计署、省政府的要求，福建省审计局组织开展1990年审计工作考核和行政执法检查。本次审计工作考核指标分三大类：（1)审计业务成果和社会效果指标。包括年度项目计划完成情况（年度总项目计划、全国项目计划、全省项目计划），违纪金额应缴财政入库率，查处重大违纪事项情况，党政领导交办事项完成情况，反映宏观经济情况报告报送篇数，反映宏观经济情况报告被批示采纳篇数。（2)审计工作质量和执法情况指标。包括审计取证是否完整，手续是否完备，对违纪事实的定量定性情况，审计处理是否正确，依据有关法律、法规和政策规定，审计结论和决定落实率，复审差错率。（3)审计机关业务管理、指导和内部管理类。包括信息材料报送和统计报告编制情况，审计机关业务建设情况，审计机关管理社会审计情况，指导内部审计机构情况，审计机关思想情况。行政执法检查内容有：各级审计机关组织学习《审计条例》、《违反财政法规处罚规定》及其《实施细则》的情况；执行《审计条例》、《违反财政法规处罚规定》过程中存在的主要问题；是否按《审计条例》规定的审计程序办事，办结的审计事项与作出的审计结论和决定是否客观公正、合规合法；处罝罚没财物和罚没款的情况；有否违法失职、违反财经法律行为的现象；有否超出法律、法规的规定，侵犯被审计单位及有关人员合法权益的行为；审计事项复审情况及复审差错情况；行政诉讼法实施前的各项准备工作情况，实施后的复议和应诉情况。
  1991年3月，福建省审计局下发《关于开展审计综合考核和行政执法检查的通知》。省审计局组成两个工作小组，邀请4位特约审计员参加，分别对漳州市审计局和龙岩地区审计局的综合考核和行政执法检查工作进行抽查，并延伸抽查了龙海、东山、永定、龙岩4个县(市）。考核结束后向审计署汇报福建省1990年度审计工作考核情况。
  同年，福建省审计局下发《关于开展1991年业务考核的通知》。本次考核增加了审计监督在宏观经济调控中发挥作用情况、审计统计和审计统计分析工作完成情况、执行业务文书底稿规范化情况等内容。
  1992年2月，福建省审计局根据《关于开展1991年度业务考核的通知》，抽查了一部分地市审计局的业务考核情况。
  1993年，福建省审计局为更好地贯彻落实中国共产党第十四次代表大会提出的强化审计监督的精神，在总结前几年业务考核工作的基础上，重新修订了全省审计业务考核办法,规定业务考核指标为7大项15小项：
  一、重点审计项目计划完成情况
  (一）署、省定计划完成情况；
  (二）完成署、省定项目质量。
  二、审计监督在宏观经济管理中发挥作用情况
  (一）综合报告被党政领导批示采用；
  (二）综合报告被党政机关批转；
  (三）综合报告批示、批转后促进建章立制；
  (四）反映宏观问题信息被采用及效果。
  三、健全审计工作报告制度情况
  (―)定期工作报告及重大事项；
  (二）发布社会关注的重大事项及在政府内部通报。
  四、审计业务建设情况
  (一）基础性制度的建立健全；
  (二）执行审计程序、规范及审计执法；
  (三）档案管理；
  (四）计算机建设及运用。
  五、对下管理与指导
  六、对社审、内审管理及指导
  七、加、扣分情况
  1994年1～2月，福建省审计局组织各地市审计局综合科长及省审计局部分人员对各地市1993年度审计业务进行考核，并通报表彰获前三名的4个地市审计局：第一名泉州市审计局，第二名龙岩地区审计局，第三名厦门市审计局、福州市审计局。
  同年，福建省审计局在1993年度审计业务考核办法的基础上，重新修订了地市审计业务考核办法。
  1995年2月，福建省审计厅组成有特约审计员参加的4个审计业务考核小组对各地市1994年度审计业务进行考核，并对获得总分前三名的地市予以表彰。获得本次业务考核总分前三名的地市依次是：龙岩地区审计局，泉州市审计局，福州市审计局、厦门市审计局。
  同年，为了贯彻《审计法》，加强同级财政预算执行情况审计，提高审计项目质量，严格审计执法，确保各项审计任务的完成，福建省审计厅下发《福建省审计业务考核办法》，对审计业务考核的原则和范围、考核内容及计分办法、考核方法及具体要求做了说明，并随文下发审计质量执法管理具体考核办法。
  12月，福建省审计厅制定《本级预算执行情况审计考核办法》，作为本省审计业务考核办法的一个组成部分。